Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85AQ96PX6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms