Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARAP1Q96P48 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARAP1Q96P48 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARAP1Q96P48 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ARAP1Q96P48 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ARAP1Q96P48 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ARAP1Q96P48 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARAP1Q96P48 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms