Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms