Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC115Q96NT0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms