Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
JSRP1Q96MG2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JSRP1Q96MG2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms