Protein–RNA interactions for Protein: Q96M98

PACRG, Parkin coregulated gene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGQ96M98 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACRGQ96M98 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PACRGQ96M98 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms