Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD4Q96M96 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms