Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms