Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms