Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOLQ96LW4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms