Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms