Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP47Q96K76 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP47Q96K76 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms