Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms