Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBED3Q96IU2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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