Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms