Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NMD3Q96D46 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms