Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms