Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF34Q969K3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms