Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCE1Q969G3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms