Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms