Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RGP1Q92546 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms