Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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COPS9Q8WXC6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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COPS9Q8WXC6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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COPS9Q8WXC6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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