Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCOLN3Q8TDD5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms