Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms