Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGBL3Q8NEM8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AGBL3Q8NEM8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms