Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RNF182Q8N6D2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RNF182Q8N6D2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RNF182Q8N6D2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RNF182Q8N6D2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RNF182Q8N6D2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RNF182Q8N6D2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RNF182Q8N6D2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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