Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL2Q8N4E4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms