Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZF0

NALCN, Sodium leak channel non-selective protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NALCNQ8IZF0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NALCNQ8IZF0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NALCNQ8IZF0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NALCNQ8IZF0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NALCNQ8IZF0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NALCNQ8IZF0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NALCNQ8IZF0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NALCNQ8IZF0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NALCNQ8IZF0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NALCNQ8IZF0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NALCNQ8IZF0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NALCNQ8IZF0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms