Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMNTD2Q8IXW0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms