Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC8AQ8IWT6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms