Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK2Q8IWQ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms