Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms