Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA4Q8IV77 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA4Q8IV77 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms