Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms