Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALYREFQ86V81 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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