Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NPM2Q86SE8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms