Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms