Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NEGR1Q7Z3B1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms