Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDPD3Q7L5L3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDPD3Q7L5L3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms