Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms