Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms