Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms