Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CASC2Q6XLA1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms