Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms