Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms