Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BLOC1S2Q6QNY1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BLOC1S2Q6QNY1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BLOC1S2Q6QNY1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BLOC1S2Q6QNY1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BLOC1S2Q6QNY1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BLOC1S2Q6QNY1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BLOC1S2Q6QNY1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BLOC1S2Q6QNY1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BLOC1S2Q6QNY1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms