Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms