Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6P435 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6P435 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6P435 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q6P435 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q6P435 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6P435 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms