Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3HQ6NTF7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms