Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUPD1Q68J44 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUPD1Q68J44 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms